产前造成智力障碍的主要困素涉及：

染色体异常

染色体是细胞核内的遗传物质，一个正常人的体细胞有23对染色体。最常见的染色体异常是唐氏综合征，患儿体细胞中的第21对染色体多一条，形成21三体，造成智力障碍。

先天代谢异常

由于遗传基因在控制人的复杂生物代谢过程中出现某种缺陷而导致代谢性疾病，严重影响脑的发育，造成智力障碍。最常见的先天性代谢疾病就是苯丙酮尿症。由于基因缺陷，人体内缺乏苯丙酸羟化酶，导致食物中所含的苯丙胺酮酸不能正常转化，积累在体内，严重影响婴儿大脑的发育，造成智力障碍。半乳糖血症也是一种先天性的造成智力障碍的糖类代谢性疾病。

脑发育异常

胚胎发育过程中由于各种原因造成脑发育不正常也会导致智力障碍。例如，早期发育过程中神经管闭锁不全而导致脑发育异常，如无脑症、脊柱裂和脑膨出等，或大脑成形缺陷，如脑回平厚、脑导水管狭窄等，这些都会严重影响大脑的智力功能，导致智力障碍。

母体因素

在孕期由于母亲营养不足导致胎儿营养不足，母亲酗酒和吸毒，母亲体温过高以及患水痘、风疹、糖尿病，母休接受放射线照射等，都可能造成胎儿智力发育迟缓。